כיח

1. נפח הדגימה הרצוי הוא 2-4 סמ"ק בצנצנת סטרילית עם מכסה מתברג.
2. יש ליטול את דגימת הכיח מחולה בצום, לפני נטילת תרופות ולאחר שטיפת הפה במים שהורתחו וקוררו קודם. יש להקפיד שהחומר יהיה כיח ולא רוק.
3. כאשר הדגימה מכילה רוק בלבד או שנפחה קטן מדי, יש לתת לחולה כלי נוסף ולא לאסוף דגימות לאותו כלי.
4. יש לחזור על בדיקת כיח לפחות 3 פעמים, ב-3 ימים עוקבים.

שתן

1. דגימת שתן לשחפת נלקחת לאחר רחיצה כמו בהטלת שתן לתרבית, בתוך כלי סטרילי שיסופק על ידי המעבדה למטרה זו בלבד!
2. יש לשלוח לבדיקה את כל השתן הראשון של הבוקר ולא איסוף של 24 שעות.
3. יש לחזור על בדיקת שתן לפחות 3 פעמים.

ניקורים ונוזלי גוף שונים

1. הדגימות יילקחו במבחנות סטריליות.
2. לנוזלי גוף העלולים להיקרש יש להוסיף באופן סטרילי נוגדי קרישה (אנטיקואגולנט): תמיסת סטוק סטרילית של citrate 2% או oxalate 2% לריכוז סופי של 0.2% (מיהול X10). אין להשתמש בEDTA או בחומר משמר. 
3. הנפח המינימלי הנדרש לביצוע הבדיקה הוא 2 סמ"ק.

פצעים ורקמות

1. רצוי לשלוח לבדיקה רקמה, נוזל או הפרשה. סיכויי בידוד מיקובקטריה מחומר שנלקח המטוש (swab) הינם קטנים.
2. אין להכניס דגימה לשחפת לכלי המכיל קרקע מזון. יש ליטול את החומר באופן סטרילי, להכניס לכלי סטרילי ולשלוח למעבדה תוך 24 שעות (ניתן לתאם טלפונית).
3. יש לפרט את מקור הדגימה (האיבר ממנו נלקחה, פצע פתוח וכד').