48-72 שעות לאחר התחלת הטיפול האמפירי יש לבצע הערכה חוזרת של החולה ולענות על השאלות הבאות-

1. הערכת אבחנת עבודה ראשונית: אבחנה זיהומית או אבחנה אלטרנטיבית
2. הערכת מצב ותגובה קלינית
3.  מעבר על תשובות תרביות ובדיקות אבחנתיות נוספות
4. יש לבדוק את הצורך בשינוי / התאמת הטיפול האנטיביוטי לפי תשובות מעבדה, הדמיה ומצב קליני של החולה
5. יש לבדוק את הצורך בהתאמת המינון לתפקוד הכלייתי והכבדי ורמת התרופה בדם (בתרופות נבחרות).
6. לשקול מעבר לטיפול פומי בהתאם למצב הקליני והאבחנה המטופלת
7. יש להפסיק את הטיפול האנטיביוטי אם בהערכה מחודשת לחולה אין זיהום
8. חובה להפסיק טיפול אנטיביוטי קודם כאשר עוברים לפרוטוקול טיפולי חדש
9. אין לטפל בקולוניזציה / קונטמינציה, תרביות ממקורות שאינן סטריליות (פצעים, נקזים, עור, צנתר שתן, כיח מצנרת מנשם וכיו"ב) ללא קורלציה קלינית.
10.  תכנון משך טיפול.

יש לתעד בגיליון- אבחנה, שינוי בטיפול ועל מה הסתמך ומשך הטיפול הצפוי.